A idade média que se seguiu foi caracterizada por um enorme respeito e admiração pelos clássicos, entre os quais se destacava Aristóteles. Portanto, nada mais importante do que compilar toda a sua obra e organizar assim uma ordem escolástica definitiva. Já no final deste período, São Tomás de Aquino (1225 - 1274) acreditava que a ordem que vemos na natureza é uma prova irrefutável da existência de Deus. Afinal, a matéria deixada por si só não poderia se organizar, a não ser que seja guiada por uma inteligência suprema.

Gradualmente a doutrina cristã passou a perceber no texto bíblico elementos que reforçavam a idéia do geocentrismo. Esta mesclagem da fé cristã com as informações astronômicas que começavam a surgir seria motivo de uma tensão entre o pensamento científico e a igreja.